轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的研究對(duì)象為特定細(xì)胞在某種功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來(lái)的所有RNA的總和，目前該測(cè)序技術(shù)主要針對(duì)mRNA。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)在檢測(cè)基因表達(dá)水平變化的同時(shí)，還能發(fā)現(xiàn)稀有轉(zhuǎn)錄本，精確地識(shí)別可變剪切位點(diǎn)、基因融合，提供最全面的轉(zhuǎn)錄組信息。通過(guò)高通量測(cè)序，能夠全面快速地獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本序列信息，已廣泛應(yīng)用于物種遺傳發(fā)育、改良，分子育種研究。